المرحلة الجراحية قد تكون مصحوبة ببعض الإزعاجات الجراحية البسيطة أو المتوسطة وذلك عند الحديث عن زراعة الأسنان التقليدية المتضمنة للفتح الجراحي، قد تستمر هذه الإزعاجات بضعة أيام ومن ثم تزول تدريجياً
لكن عند الحديث عن زراعة الأسنان الموجهة يكون الوضع مختلفاً بشكل كبير حيث تنخفض مستويات الألم أو الإزعاج الى مستويات متدنية جداً وقد تنعدم تماماً وتتم العملية من دون أي ألم
أما المرحلة التركيبية فهي غير مؤلمة إطلاقاً
